De Jonge Hendrik is in 1875 gebouwd door molenmaker Jan Hendriks van der Veen uit Mensingeweer met een achtkant en kap van een in 1874 afgebroken korenmolen uit Niekerk (gemeente Grootegast), aldaar gebouwd in 1847 ter vervanging van een standerdmolen uit 1610. Deze standerdmolen had een vlucht van 18,80 meter. Thans dient de oude standerd nog steeds als koningspil!
Het spoorwiel, diameter 2,96 meter, is het omgebouwde bovenwiel uit diezelfde standerdmolen. De inkepingen voor de acht plooistukken zijn in de kruisarmen nog zichtbaar.

Op de plaats van De Jonge Hendrik hebben twee voorgangers gestaan, gebouwd in 1852 en 1859, beide afgebrand en beide genaamd 'Noordermolen', ter onderscheiding van een andere molen nabij de kerk aan de zuidkant van het dorp, met de naam Zuidermolen; deze brandde in 1878 af (en werd niet meer herbouwd).

Ooit werd hier gemalen met drie koppel stenen (waarvan er nog één rest) maar deze molen kreeg vooral bekendheid als pelmolen: jarenlang was Tiddo Muda hier de mulder/pelder. Feitelijk ging deze molen door voor de enige in Nederland waar nog geregeld werd gepeld. Niet dagelijks, want voor pellen is veel wind nodig. Met windkracht 6 begint het en met windkracht 7 gaat het pas echt goed! 

In 1972 onderging de molen een grote restauratie. Hierbij heeft de fa. Bremer met name het zeer intensief gebruikte pelwerk grondig herzien en deels moeten vernieuwen. Zo waren beide stenen totaal 'op', zij zijn vervangen door exemplaren uit de - destijds zwaar vervallen - Aeolus te Farmsum.
Uiteindelijk kwam aan het productieve bestaan van deze molen een einde: 29 januari 1983 werd er voor het laatst gepeld en juli 1998 voor het laatst gemalen. Echte stilstand volgde niet, want er werd af en toe nog gedraaid; het beste was er evenwel van af.

In 2002 werd, vooruitlopend op verder herstel, de stelling geheel vernieuwd. In oktober 2004 begon de fa. Dunning met de restauratie: zo stak men een nieuwe buitenroede. Helaas bleek toen dat de binnenroede veel slechter was dan verondersteld, de molen kon niet draaivaardig worden opgeleverd. Deze tegenvaller moest opnieuw worden gefinancierd en dat kostte tijd.
In 2006 werd eerst divers klein herstel verricht en in juli 2007 volgden dan een nieuwe binnenroede en lange spruit. Sindsdien wordt de molen weer geregeld aan het draaien gebracht.